Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SKIP12755 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKIP12755 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKIP12755 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKIP12755 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKIP12755 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SKIP12755 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKIP12755 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKIP12755 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SKIP12755 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKIP12755 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKIP12755 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKIP12755 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKIP12755 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKIP12755 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKIP12755 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKIP12755 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKIP12755 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKIP12755 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKIP12755 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKIP12755 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKIP12755 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKIP12755 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKIP12755 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKIP12755 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKIP12755 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKIP12755 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKIP12755 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKIP12755 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKIP12755 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKIP12755 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKIP12755 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SKIP12755 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKIP12755 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKIP12755 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKIP12755 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKIP12755 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SKIP12755 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SKIP12755 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKIP12755 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKIP12755 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SKIP12755 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKIP12755 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SKIP12755 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SKIP12755 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKIP12755 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SKIP12755 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SKIP12755 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SKIP12755 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SKIP12755 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKIP12755 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKIP12755 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKIP12755 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SKIP12755 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SKIP12755 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKIP12755 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKIP12755 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKIP12755 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKIP12755 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKIP12755 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SKIP12755 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKIP12755 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKIP12755 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SKIP12755 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SKIP12755 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SKIP12755 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SKIP12755 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SKIP12755 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SKIP12755 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKIP12755 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SKIP12755 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SKIP12755 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SKIP12755 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SKIP12755 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKIP12755 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKIP12755 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SKIP12755 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKIP12755 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SKIP12755 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKIP12755 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SKIP12755 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKIP12755 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SKIP12755 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SKIP12755 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SKIP12755 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKIP12755 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKIP12755 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKIP12755 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKIP12755 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKIP12755 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKIP12755 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SKIP12755 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKIP12755 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKIP12755 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKIP12755 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKIP12755 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKIP12755 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKIP12755 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SKIP12755 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKIP12755 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms