Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FCER1AP12319 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FCER1AP12319 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FCER1AP12319 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FCER1AP12319 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms