Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COL6A2P12110 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL6A2P12110 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL6A2P12110 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL6A2P12110 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms