Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB1P11230 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNB1P11230 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNB1P11230 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms