Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPP1P10451 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPP1P10451 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPP1P10451 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPP1P10451 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPP1P10451 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPP1P10451 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPP1P10451 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPP1P10451 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPP1P10451 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPP1P10451 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPP1P10451 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPP1P10451 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPP1P10451 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPP1P10451 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPP1P10451 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPP1P10451 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPP1P10451 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPP1P10451 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPP1P10451 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPP1P10451 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPP1P10451 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPP1P10451 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPP1P10451 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPP1P10451 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPP1P10451 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPP1P10451 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPP1P10451 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPP1P10451 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPP1P10451 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPP1P10451 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPP1P10451 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPP1P10451 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPP1P10451 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPP1P10451 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPP1P10451 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPP1P10451 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPP1P10451 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPP1P10451 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPP1P10451 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPP1P10451 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPP1P10451 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPP1P10451 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPP1P10451 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPP1P10451 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPP1P10451 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPP1P10451 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPP1P10451 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPP1P10451 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPP1P10451 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPP1P10451 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPP1P10451 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPP1P10451 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPP1P10451 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPP1P10451 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPP1P10451 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPP1P10451 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPP1P10451 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPP1P10451 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPP1P10451 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPP1P10451 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPP1P10451 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPP1P10451 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPP1P10451 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPP1P10451 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPP1P10451 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPP1P10451 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPP1P10451 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPP1P10451 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPP1P10451 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPP1P10451 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPP1P10451 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPP1P10451 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPP1P10451 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPP1P10451 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPP1P10451 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPP1P10451 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPP1P10451 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPP1P10451 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPP1P10451 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPP1P10451 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPP1P10451 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPP1P10451 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPP1P10451 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPP1P10451 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPP1P10451 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPP1P10451 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPP1P10451 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPP1P10451 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPP1P10451 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPP1P10451 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPP1P10451 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPP1P10451 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPP1P10451 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPP1P10451 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPP1P10451 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPP1P10451 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPP1P10451 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPP1P10451 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPP1P10451 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms