Protein–RNA interactions for Protein: P10155

TROVE2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROVE2P10155 NCOR1-221ENST00000582357 1877 ntTSL 1 (best)20.31■□□□□ 0.849e-7■■■■■ 31
TROVE2P10155 CKB-209ENST00000554705 803 ntTSL 218.08■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 31
TROVE2P10155 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 517.08■□□□□ 0.329e-7■■■■■ 31
TROVE2P10155 CKB-215ENST00000557287 565 ntTSL 217.08■□□□□ 0.329e-7■■■■■ 31
TROVE2P10155 CKB-213ENST00000555659 755 ntTSL 216.3■□□□□ 0.29e-7■■■■■ 31
TROVE2P10155 CKB-202ENST00000553528 1170 ntTSL 215.56■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 31
TROVE2P10155 CHAF1A-202ENST00000585371 884 ntTSL 512.37□□□□□ -0.439e-7■■■■■ 31
TROVE2P10155 CHAF1A-206ENST00000587739 875 ntTSL 58.94□□□□□ -0.989e-7■■■■■ 31
TROVE2P10155 KANSL1-225ENST00000639356 1717 ntTSL 518.88■□□□□ 0.613e-17■■■■■ 30.7
TROVE2P10155 KANSL1-214ENST00000576739 592 ntTSL 218.85■□□□□ 0.613e-17■■■■■ 30.7
TROVE2P10155 KANSL1-223ENST00000639150 1815 ntTSL 516.84■□□□□ 0.293e-17■■■■■ 30.7
TROVE2P10155 KANSL1-209ENST00000574655 1681 ntTSL 516.14■□□□□ 0.183e-17■■■■■ 30.7
TROVE2P10155 KANSL1-222ENST00000639099 1724 ntTSL 516.08■□□□□ 0.173e-17■■■■■ 30.7
TROVE2P10155 KANSL1-221ENST00000638902 1971 ntTSL 213.72□□□□□ -0.213e-17■■■■■ 30.7
TROVE2P10155 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.293e-17■■■■■ 30.7
TROVE2P10155 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.433e-17■■■■■ 30.7
TROVE2P10155 KANSL1-217ENST00000638269 3365 ntTSL 510.94□□□□□ -0.663e-17■■■■■ 30.7
TROVE2P10155 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.793e-17■■■■■ 30.7
TROVE2P10155 KANSL1-226ENST00000639375 3392 ntTSL 58.92□□□□□ -0.983e-17■■■■■ 30.7
TROVE2P10155 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.423e-17■■■■■ 30.7
TROVE2P10155 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 30.4
TROVE2P10155 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 30.3
TROVE2P10155 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.016e-8■■■■■ 30.3
TROVE2P10155 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.116e-8■■■■■ 30.3
TROVE2P10155 FAM19A5-205ENST00000473898 897 ntTSL 217■□□□□ 0.316e-8■■■■■ 30.3
TROVE2P10155 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.016e-8■■■■■ 30.3
TROVE2P10155 FAM19A5-201ENST00000336769 546 ntTSL 411.43□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 30.3
TROVE2P10155 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.465e-6■■■■■ 29.9
TROVE2P10155 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.985e-6■■■■■ 29.9
TROVE2P10155 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.215e-6■■■■■ 29.9
TROVE2P10155 SLC16A1-204ENST00000458229 2201 ntTSL 219.09■□□□□ 0.653e-25■■■■■ 29.8
TROVE2P10155 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.083e-25■■■■■ 29.8
TROVE2P10155 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.053e-25■■■■■ 29.8
TROVE2P10155 SLC16A1-202ENST00000429288 865 ntTSL 311.25□□□□□ -0.613e-25■■■■■ 29.8
TROVE2P10155 SLC16A1-203ENST00000443580 1099 ntTSL 38.36□□□□□ -1.073e-25■■■■■ 29.8
TROVE2P10155 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.525e-7■■■■■ 29.8
TROVE2P10155 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 29.8
TROVE2P10155 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 29.8
TROVE2P10155 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 29.4
TROVE2P10155 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 29.4
TROVE2P10155 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 29.4
TROVE2P10155 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 29.4
TROVE2P10155 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 29.4
TROVE2P10155 PRKN-207ENST00000479615 904 ntTSL 513.18□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 29.4
TROVE2P10155 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 29.4
TROVE2P10155 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.793e-7■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 PTPN18-207ENST00000462321 1717 ntTSL 219.4■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 PTPN18-211ENST00000481492 1394 ntTSL 218.31■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 MRM2-204ENST00000467199 1819 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 PTPN18-203ENST00000409022 993 ntTSL 316.36■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 MRM2-205ENST00000486040 2511 ntTSL 1 (best)15.93■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 MIB1-204ENST00000578646 3306 ntTSL 211.56□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.282e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.52e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.552e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 GCLC-203ENST00000504525 1011 ntTSL 319.59■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 GCLC-208ENST00000513939 519 ntTSL 28.23□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 GCLC-205ENST00000505294 847 ntTSL 35.61□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 GCLC-211ENST00000514933 542 ntTSL 54.39□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 29.3
TROVE2P10155 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.541e-6■■■■■ 29.1
TROVE2P10155 QDPR-205ENST00000507439 1374 ntTSL 222.95■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 29.1
TROVE2P10155 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 29.1
TROVE2P10155 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 29.1
TROVE2P10155 QDPR-203ENST00000501943 803 ntTSL 210.29□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 29.1
TROVE2P10155 AP000781.2-201ENST00000534081 1639 ntTSL 213.47□□□□□ -0.255e-9■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.365e-9■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.555e-9■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PRG2-204ENST00000533605 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.595e-9■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PRG2-203ENST00000530105 1048 ntTSL 510.93□□□□□ -0.665e-9■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.33e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.063e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PRKCZ-201ENST00000378567 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)23.02■■□□□ 1.283e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PRKCZ-215ENST00000479263 1747 ntTSL 221.34■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 KMT2A-209ENST00000531904 4320 ntTSL 220.2■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PRKCZ-226ENST00000505322 1859 ntTSL 219.27■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 CCND1-206ENST00000545484 430 ntTSL 518.99■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 ZNF326-204ENST00000394583 1956 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 218.44■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 318■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 418■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 28.8
TROVE2P10155 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 28.8
Retrieved 100 of 4,203 protein–RNA pairs in 241.4 ms