Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNX1P0DP58 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYNX1P0DP58 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYNX1P0DP58 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYNX1P0DP58 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYNX1P0DP58 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LYNX1P0DP58 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYNX1P0DP58 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LYNX1P0DP58 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYNX1P0DP58 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LYNX1P0DP58 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYNX1P0DP58 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYNX1P0DP58 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYNX1P0DP58 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYNX1P0DP58 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYNX1P0DP58 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYNX1P0DP58 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms