Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMIGD3P0DMS9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD3P0DMS9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMIGD3P0DMS9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms