Protein–RNA interactions for Protein: P0C7U9

FAM87A, Protein FAM87A, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM87AP0C7U9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM87AP0C7U9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM87AP0C7U9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM87AP0C7U9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM87AP0C7U9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM87AP0C7U9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM87AP0C7U9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM87AP0C7U9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM87AP0C7U9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM87AP0C7U9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM87AP0C7U9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM87AP0C7U9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM87AP0C7U9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM87AP0C7U9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM87AP0C7U9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM87AP0C7U9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM87AP0C7U9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM87AP0C7U9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM87AP0C7U9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms