Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P2

RFPL3S, Putative protein RFPL3S, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3SP0C7P2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL3SP0C7P2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL3SP0C7P2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL3SP0C7P2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL3SP0C7P2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL3SP0C7P2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL3SP0C7P2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFPL3SP0C7P2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFPL3SP0C7P2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL3SP0C7P2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL3SP0C7P2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms