Protein–RNA interactions for Protein: P0C2L3

FAM163B, Protein FAM163B, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM163BP0C2L3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM163BP0C2L3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM163BP0C2L3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM163BP0C2L3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM163BP0C2L3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM163BP0C2L3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM163BP0C2L3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM163BP0C2L3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FAM163BP0C2L3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM163BP0C2L3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM163BP0C2L3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms