Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC6P09630 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXC6P09630 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXC6P09630 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXC6P09630 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms