Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTAP09496 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTAP09496 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTAP09496 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTAP09496 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTAP09496 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTAP09496 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTAP09496 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTAP09496 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTAP09496 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLTAP09496 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTAP09496 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTAP09496 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTAP09496 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTAP09496 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTAP09496 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLTAP09496 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTAP09496 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTAP09496 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTAP09496 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLTAP09496 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTAP09496 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLTAP09496 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTAP09496 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTAP09496 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTAP09496 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTAP09496 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTAP09496 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTAP09496 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTAP09496 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTAP09496 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTAP09496 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTAP09496 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTAP09496 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTAP09496 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTAP09496 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTAP09496 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTAP09496 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTAP09496 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTAP09496 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTAP09496 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTAP09496 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTAP09496 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTAP09496 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTAP09496 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTAP09496 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTAP09496 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTAP09496 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTAP09496 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTAP09496 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTAP09496 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLTAP09496 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTAP09496 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTAP09496 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTAP09496 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTAP09496 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTAP09496 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTAP09496 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTAP09496 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTAP09496 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTAP09496 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTAP09496 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTAP09496 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTAP09496 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTAP09496 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTAP09496 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTAP09496 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTAP09496 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTAP09496 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTAP09496 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTAP09496 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTAP09496 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTAP09496 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLTAP09496 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CLTAP09496 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTAP09496 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLTAP09496 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTAP09496 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTAP09496 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTAP09496 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLTAP09496 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CLTAP09496 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTAP09496 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTAP09496 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLTAP09496 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CLTAP09496 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTAP09496 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTAP09496 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTAP09496 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTAP09496 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTAP09496 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTAP09496 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTAP09496 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTAP09496 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTAP09496 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTAP09496 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLTAP09496 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTAP09496 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTAP09496 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTAP09496 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms