Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TNP1P09430 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TNP1P09430 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TNP1P09430 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TNP1P09430 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TNP1P09430 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TNP1P09430 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TNP1P09430 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TNP1P09430 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TNP1P09430 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TNP1P09430 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TNP1P09430 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TNP1P09430 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TNP1P09430 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TNP1P09430 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TNP1P09430 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TNP1P09430 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TNP1P09430 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TNP1P09430 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP1P09430 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP1P09430 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP1P09430 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP1P09430 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP1P09430 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP1P09430 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP1P09430 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP1P09430 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP1P09430 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP1P09430 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP1P09430 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP1P09430 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP1P09430 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP1P09430 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP1P09430 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP1P09430 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP1P09430 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP1P09430 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TNP1P09430 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP1P09430 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP1P09430 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP1P09430 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP1P09430 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP1P09430 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP1P09430 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNP1P09430 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP1P09430 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP1P09430 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP1P09430 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP1P09430 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP1P09430 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP1P09430 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNP1P09430 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP1P09430 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP1P09430 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP1P09430 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP1P09430 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP1P09430 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP1P09430 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP1P09430 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP1P09430 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP1P09430 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP1P09430 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP1P09430 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP1P09430 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP1P09430 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP1P09430 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP1P09430 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP1P09430 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP1P09430 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP1P09430 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP1P09430 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP1P09430 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP1P09430 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP1P09430 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP1P09430 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP1P09430 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP1P09430 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP1P09430 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP1P09430 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP1P09430 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP1P09430 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP1P09430 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP1P09430 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP1P09430 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP1P09430 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP1P09430 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNP1P09430 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms