Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPB2P08579 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRPB2P08579 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPB2P08579 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPB2P08579 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms