Protein–RNA interactions for Protein: P08047

SP1, Transcription factor Sp1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1P08047 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP1P08047 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP1P08047 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP1P08047 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SP1P08047 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP1P08047 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP1P08047 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP1P08047 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP1P08047 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SP1P08047 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP1P08047 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP1P08047 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP1P08047 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP1P08047 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SP1P08047 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP1P08047 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP1P08047 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP1P08047 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP1P08047 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP1P08047 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP1P08047 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP1P08047 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP1P08047 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP1P08047 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP1P08047 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP1P08047 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP1P08047 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP1P08047 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SP1P08047 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP1P08047 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP1P08047 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP1P08047 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP1P08047 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SP1P08047 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP1P08047 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP1P08047 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP1P08047 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP1P08047 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP1P08047 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP1P08047 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP1P08047 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP1P08047 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP1P08047 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP1P08047 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP1P08047 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP1P08047 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SP1P08047 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP1P08047 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP1P08047 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP1P08047 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SP1P08047 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP1P08047 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP1P08047 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP1P08047 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP1P08047 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP1P08047 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP1P08047 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP1P08047 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP1P08047 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SP1P08047 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP1P08047 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP1P08047 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP1P08047 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP1P08047 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP1P08047 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SP1P08047 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP1P08047 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP1P08047 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP1P08047 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP1P08047 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP1P08047 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP1P08047 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP1P08047 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP1P08047 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP1P08047 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP1P08047 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP1P08047 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP1P08047 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP1P08047 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP1P08047 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP1P08047 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP1P08047 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SP1P08047 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP1P08047 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP1P08047 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP1P08047 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP1P08047 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP1P08047 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP1P08047 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP1P08047 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP1P08047 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP1P08047 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP1P08047 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP1P08047 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP1P08047 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP1P08047 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP1P08047 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP1P08047 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP1P08047 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP1P08047 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms