Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GJB1P08034 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJB1P08034 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJB1P08034 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJB1P08034 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJB1P08034 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJB1P08034 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GJB1P08034 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJB1P08034 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJB1P08034 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJB1P08034 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJB1P08034 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJB1P08034 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJB1P08034 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJB1P08034 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJB1P08034 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJB1P08034 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJB1P08034 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GJB1P08034 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJB1P08034 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJB1P08034 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJB1P08034 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJB1P08034 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB1P08034 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB1P08034 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB1P08034 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB1P08034 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB1P08034 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB1P08034 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB1P08034 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB1P08034 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB1P08034 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB1P08034 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJB1P08034 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJB1P08034 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJB1P08034 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJB1P08034 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJB1P08034 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJB1P08034 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJB1P08034 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJB1P08034 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJB1P08034 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJB1P08034 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GJB1P08034 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB1P08034 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB1P08034 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB1P08034 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB1P08034 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GJB1P08034 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJB1P08034 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJB1P08034 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJB1P08034 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJB1P08034 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJB1P08034 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJB1P08034 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJB1P08034 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GJB1P08034 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJB1P08034 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GJB1P08034 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJB1P08034 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJB1P08034 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
GJB1P08034 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
GJB1P08034 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJB1P08034 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
GJB1P08034 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJB1P08034 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJB1P08034 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB1P08034 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB1P08034 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB1P08034 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB1P08034 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJB1P08034 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJB1P08034 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJB1P08034 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJB1P08034 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB1P08034 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB1P08034 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB1P08034 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB1P08034 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB1P08034 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJB1P08034 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJB1P08034 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJB1P08034 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJB1P08034 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJB1P08034 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB1P08034 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
GJB1P08034 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB1P08034 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB1P08034 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB1P08034 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB1P08034 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB1P08034 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB1P08034 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB1P08034 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB1P08034 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJB1P08034 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB1P08034 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB1P08034 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB1P08034 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB1P08034 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms