Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLK3P07288 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLK3P07288 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLK3P07288 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLK3P07288 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLK3P07288 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLK3P07288 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLK3P07288 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLK3P07288 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLK3P07288 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLK3P07288 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLK3P07288 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLK3P07288 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLK3P07288 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLK3P07288 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLK3P07288 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLK3P07288 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLK3P07288 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLK3P07288 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLK3P07288 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLK3P07288 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLK3P07288 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLK3P07288 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLK3P07288 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLK3P07288 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLK3P07288 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLK3P07288 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLK3P07288 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLK3P07288 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLK3P07288 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLK3P07288 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLK3P07288 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLK3P07288 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLK3P07288 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLK3P07288 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLK3P07288 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLK3P07288 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLK3P07288 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLK3P07288 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLK3P07288 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLK3P07288 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KLK3P07288 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLK3P07288 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLK3P07288 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLK3P07288 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLK3P07288 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLK3P07288 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLK3P07288 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLK3P07288 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLK3P07288 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLK3P07288 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLK3P07288 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLK3P07288 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLK3P07288 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLK3P07288 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLK3P07288 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLK3P07288 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLK3P07288 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLK3P07288 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLK3P07288 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KLK3P07288 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLK3P07288 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLK3P07288 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLK3P07288 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLK3P07288 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLK3P07288 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLK3P07288 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLK3P07288 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLK3P07288 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLK3P07288 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLK3P07288 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLK3P07288 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLK3P07288 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLK3P07288 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLK3P07288 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLK3P07288 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLK3P07288 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLK3P07288 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLK3P07288 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLK3P07288 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLK3P07288 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLK3P07288 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLK3P07288 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLK3P07288 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLK3P07288 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLK3P07288 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLK3P07288 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLK3P07288 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLK3P07288 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLK3P07288 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLK3P07288 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLK3P07288 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLK3P07288 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLK3P07288 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLK3P07288 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLK3P07288 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLK3P07288 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KLK3P07288 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLK3P07288 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLK3P07288 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms