Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APODP05090 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APODP05090 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APODP05090 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APODP05090 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
APODP05090 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APODP05090 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APODP05090 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APODP05090 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APODP05090 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APODP05090 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APODP05090 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APODP05090 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APODP05090 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APODP05090 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APODP05090 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
APODP05090 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APODP05090 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APODP05090 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APODP05090 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APODP05090 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APODP05090 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APODP05090 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APODP05090 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APODP05090 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APODP05090 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APODP05090 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APODP05090 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APODP05090 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APODP05090 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APODP05090 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APODP05090 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APODP05090 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APODP05090 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APODP05090 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APODP05090 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APODP05090 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APODP05090 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APODP05090 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APODP05090 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APODP05090 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
APODP05090 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APODP05090 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APODP05090 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APODP05090 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APODP05090 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APODP05090 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APODP05090 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APODP05090 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
APODP05090 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APODP05090 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APODP05090 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APODP05090 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
APODP05090 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APODP05090 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
APODP05090 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APODP05090 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APODP05090 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APODP05090 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APODP05090 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APODP05090 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APODP05090 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APODP05090 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APODP05090 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APODP05090 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APODP05090 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APODP05090 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APODP05090 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APODP05090 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APODP05090 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APODP05090 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APODP05090 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APODP05090 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APODP05090 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
APODP05090 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APODP05090 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APODP05090 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APODP05090 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APODP05090 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
APODP05090 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APODP05090 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APODP05090 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APODP05090 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
APODP05090 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APODP05090 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APODP05090 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APODP05090 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APODP05090 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APODP05090 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APODP05090 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APODP05090 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APODP05090 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APODP05090 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APODP05090 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APODP05090 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APODP05090 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APODP05090 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APODP05090 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APODP05090 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APODP05090 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms