Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
A1BGP04217 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
A1BGP04217 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
A1BGP04217 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
A1BGP04217 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
A1BGP04217 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
A1BGP04217 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
A1BGP04217 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
A1BGP04217 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
A1BGP04217 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
A1BGP04217 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
A1BGP04217 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
A1BGP04217 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
A1BGP04217 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
A1BGP04217 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
A1BGP04217 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
A1BGP04217 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
A1BGP04217 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
A1BGP04217 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
A1BGP04217 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
A1BGP04217 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
A1BGP04217 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
A1BGP04217 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
A1BGP04217 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
A1BGP04217 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
A1BGP04217 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
A1BGP04217 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
A1BGP04217 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
A1BGP04217 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
A1BGP04217 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
A1BGP04217 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
A1BGP04217 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
A1BGP04217 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
A1BGP04217 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
A1BGP04217 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
A1BGP04217 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
A1BGP04217 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
A1BGP04217 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
A1BGP04217 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
A1BGP04217 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
A1BGP04217 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
A1BGP04217 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
A1BGP04217 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
A1BGP04217 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
A1BGP04217 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
A1BGP04217 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
A1BGP04217 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
A1BGP04217 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
A1BGP04217 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
A1BGP04217 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
A1BGP04217 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
A1BGP04217 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
A1BGP04217 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
A1BGP04217 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
A1BGP04217 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
A1BGP04217 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
A1BGP04217 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
A1BGP04217 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
A1BGP04217 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
A1BGP04217 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
A1BGP04217 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
A1BGP04217 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
A1BGP04217 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
A1BGP04217 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
A1BGP04217 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
A1BGP04217 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
A1BGP04217 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
A1BGP04217 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
A1BGP04217 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
A1BGP04217 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
A1BGP04217 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
A1BGP04217 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
A1BGP04217 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
A1BGP04217 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
A1BGP04217 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
A1BGP04217 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
A1BGP04217 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
A1BGP04217 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
A1BGP04217 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
A1BGP04217 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
A1BGP04217 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
A1BGP04217 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
A1BGP04217 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
A1BGP04217 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
A1BGP04217 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
A1BGP04217 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
A1BGP04217 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
A1BGP04217 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
A1BGP04217 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
A1BGP04217 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
A1BGP04217 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
A1BGP04217 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
A1BGP04217 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
A1BGP04217 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
A1BGP04217 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
A1BGP04217 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
A1BGP04217 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
A1BGP04217 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
A1BGP04217 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
A1BGP04217 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms