Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-9P01782 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-9P01782 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-9P01782 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-9P01782 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-9P01782 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-9P01782 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-9P01782 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-9P01782 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-9P01782 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-9P01782 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGHV3-9P01782 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-9P01782 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms