Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALCAP01258 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALCAP01258 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CALCAP01258 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALCAP01258 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALCAP01258 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALCAP01258 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALCAP01258 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CALCAP01258 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALCAP01258 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALCAP01258 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALCAP01258 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALCAP01258 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCAP01258 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCAP01258 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCAP01258 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCAP01258 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCAP01258 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCAP01258 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCAP01258 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCAP01258 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALCAP01258 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CALCAP01258 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALCAP01258 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALCAP01258 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALCAP01258 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALCAP01258 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALCAP01258 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALCAP01258 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALCAP01258 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALCAP01258 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALCAP01258 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALCAP01258 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALCAP01258 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALCAP01258 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALCAP01258 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALCAP01258 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCAP01258 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCAP01258 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCAP01258 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCAP01258 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCAP01258 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCAP01258 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CALCAP01258 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALCAP01258 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALCAP01258 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALCAP01258 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALCAP01258 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CALCAP01258 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALCAP01258 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALCAP01258 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CALCAP01258 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALCAP01258 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALCAP01258 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALCAP01258 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALCAP01258 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALCAP01258 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCAP01258 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCAP01258 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCAP01258 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCAP01258 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCAP01258 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCAP01258 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALCAP01258 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALCAP01258 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALCAP01258 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALCAP01258 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALCAP01258 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALCAP01258 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALCAP01258 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALCAP01258 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALCAP01258 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALCAP01258 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALCAP01258 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALCAP01258 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALCAP01258 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALCAP01258 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALCAP01258 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CALCAP01258 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALCAP01258 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALCAP01258 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CALCAP01258 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCAP01258 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCAP01258 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCAP01258 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCAP01258 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCAP01258 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCAP01258 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCAP01258 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCAP01258 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCAP01258 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCAP01258 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCAP01258 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCAP01258 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCAP01258 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCAP01258 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCAP01258 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCAP01258 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCAP01258 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALCAP01258 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms