Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SERPINA1P01009 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SERPINA1P01009 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINA1P01009 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms