Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPNE6O95741 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPNE6O95741 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms