Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POP4O95707 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POP4O95707 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POP4O95707 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POP4O95707 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POP4O95707 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POP4O95707 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POP4O95707 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POP4O95707 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POP4O95707 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POP4O95707 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POP4O95707 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POP4O95707 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POP4O95707 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP4O95707 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP4O95707 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP4O95707 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP4O95707 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP4O95707 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP4O95707 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP4O95707 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POP4O95707 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POP4O95707 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP4O95707 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP4O95707 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP4O95707 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP4O95707 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP4O95707 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP4O95707 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POP4O95707 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POP4O95707 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POP4O95707 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POP4O95707 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POP4O95707 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POP4O95707 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POP4O95707 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POP4O95707 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POP4O95707 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POP4O95707 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POP4O95707 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POP4O95707 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POP4O95707 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP4O95707 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP4O95707 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP4O95707 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP4O95707 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP4O95707 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP4O95707 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP4O95707 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP4O95707 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POP4O95707 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POP4O95707 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POP4O95707 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POP4O95707 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POP4O95707 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP4O95707 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP4O95707 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP4O95707 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP4O95707 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP4O95707 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP4O95707 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POP4O95707 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POP4O95707 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POP4O95707 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POP4O95707 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POP4O95707 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POP4O95707 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP4O95707 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP4O95707 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP4O95707 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP4O95707 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP4O95707 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP4O95707 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP4O95707 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POP4O95707 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POP4O95707 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POP4O95707 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POP4O95707 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POP4O95707 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POP4O95707 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POP4O95707 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POP4O95707 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POP4O95707 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POP4O95707 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POP4O95707 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POP4O95707 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POP4O95707 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POP4O95707 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POP4O95707 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POP4O95707 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POP4O95707 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POP4O95707 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POP4O95707 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POP4O95707 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POP4O95707 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POP4O95707 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POP4O95707 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POP4O95707 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POP4O95707 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POP4O95707 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms