Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN4O95460 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN4O95460 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MATN4O95460 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MATN4O95460 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MATN4O95460 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MATN4O95460 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MATN4O95460 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN4O95460 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN4O95460 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN4O95460 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN4O95460 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MATN4O95460 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MATN4O95460 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MATN4O95460 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MATN4O95460 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MATN4O95460 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MATN4O95460 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MATN4O95460 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MATN4O95460 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN4O95460 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN4O95460 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN4O95460 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN4O95460 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN4O95460 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN4O95460 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MATN4O95460 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MATN4O95460 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN4O95460 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN4O95460 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN4O95460 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN4O95460 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN4O95460 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN4O95460 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MATN4O95460 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MATN4O95460 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN4O95460 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN4O95460 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN4O95460 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN4O95460 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN4O95460 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN4O95460 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN4O95460 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MATN4O95460 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MATN4O95460 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MATN4O95460 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MATN4O95460 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MATN4O95460 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MATN4O95460 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MATN4O95460 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MATN4O95460 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MATN4O95460 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MATN4O95460 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MATN4O95460 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MATN4O95460 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MATN4O95460 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MATN4O95460 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MATN4O95460 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MATN4O95460 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MATN4O95460 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MATN4O95460 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MATN4O95460 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MATN4O95460 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MATN4O95460 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MATN4O95460 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MATN4O95460 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MATN4O95460 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MATN4O95460 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MATN4O95460 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MATN4O95460 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MATN4O95460 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MATN4O95460 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MATN4O95460 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MATN4O95460 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MATN4O95460 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MATN4O95460 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MATN4O95460 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MATN4O95460 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MATN4O95460 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MATN4O95460 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MATN4O95460 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MATN4O95460 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MATN4O95460 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MATN4O95460 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MATN4O95460 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MATN4O95460 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MATN4O95460 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MATN4O95460 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MATN4O95460 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MATN4O95460 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MATN4O95460 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MATN4O95460 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MATN4O95460 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MATN4O95460 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN4O95460 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN4O95460 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN4O95460 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN4O95460 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN4O95460 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN4O95460 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms