Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT38O76015 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT38O76015 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT38O76015 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT38O76015 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT38O76015 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT38O76015 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT38O76015 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT38O76015 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT38O76015 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT38O76015 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT38O76015 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT38O76015 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT38O76015 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT38O76015 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT38O76015 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT38O76015 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT38O76015 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT38O76015 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT38O76015 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT38O76015 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT38O76015 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT38O76015 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT38O76015 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT38O76015 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT38O76015 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT38O76015 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT38O76015 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT38O76015 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT38O76015 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT38O76015 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT38O76015 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT38O76015 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT38O76015 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT38O76015 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT38O76015 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT38O76015 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT38O76015 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT38O76015 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT38O76015 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT38O76015 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT38O76015 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT38O76015 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT38O76015 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT38O76015 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT38O76015 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT38O76015 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT38O76015 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT38O76015 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT38O76015 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT38O76015 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT38O76015 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT38O76015 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT38O76015 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT38O76015 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT38O76015 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT38O76015 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT38O76015 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT38O76015 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT38O76015 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT38O76015 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT38O76015 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT38O76015 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT38O76015 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT38O76015 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT38O76015 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT38O76015 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT38O76015 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT38O76015 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT38O76015 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT38O76015 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT38O76015 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT38O76015 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT38O76015 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT38O76015 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT38O76015 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT38O76015 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT38O76015 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT38O76015 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT38O76015 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT38O76015 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT38O76015 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT38O76015 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT38O76015 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT38O76015 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT38O76015 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT38O76015 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT38O76015 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT38O76015 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT38O76015 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT38O76015 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT38O76015 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT38O76015 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT38O76015 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT38O76015 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT38O76015 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT38O76015 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT38O76015 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT38O76015 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT38O76015 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms