Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP2O75604 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP2O75604 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP2O75604 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP2O75604 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP2O75604 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP2O75604 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP2O75604 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP2O75604 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
USP2O75604 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP2O75604 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
USP2O75604 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
USP2O75604 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
USP2O75604 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
USP2O75604 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP2O75604 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP2O75604 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP2O75604 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP2O75604 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP2O75604 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP2O75604 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP2O75604 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP2O75604 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP2O75604 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP2O75604 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP2O75604 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP2O75604 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP2O75604 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP2O75604 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP2O75604 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP2O75604 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP2O75604 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP2O75604 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP2O75604 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP2O75604 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP2O75604 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
USP2O75604 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP2O75604 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP2O75604 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
USP2O75604 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP2O75604 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP2O75604 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP2O75604 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP2O75604 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP2O75604 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP2O75604 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP2O75604 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
USP2O75604 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP2O75604 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP2O75604 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP2O75604 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP2O75604 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP2O75604 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP2O75604 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP2O75604 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP2O75604 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP2O75604 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP2O75604 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP2O75604 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP2O75604 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP2O75604 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP2O75604 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP2O75604 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP2O75604 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP2O75604 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP2O75604 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP2O75604 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP2O75604 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP2O75604 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP2O75604 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP2O75604 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
USP2O75604 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP2O75604 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP2O75604 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP2O75604 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP2O75604 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
USP2O75604 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP2O75604 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
USP2O75604 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP2O75604 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP2O75604 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP2O75604 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP2O75604 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP2O75604 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP2O75604 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP2O75604 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
USP2O75604 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP2O75604 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP2O75604 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP2O75604 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP2O75604 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP2O75604 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP2O75604 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP2O75604 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP2O75604 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP2O75604 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP2O75604 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP2O75604 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
USP2O75604 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP2O75604 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms