Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSDE1O75534 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CSDE1O75534 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSDE1O75534 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSDE1O75534 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSDE1O75534 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms