Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
VAMP4O75379 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
VAMP4O75379 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
VAMP4O75379 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
VAMP4O75379 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
VAMP4O75379 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
VAMP4O75379 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
VAMP4O75379 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
VAMP4O75379 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
VAMP4O75379 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
VAMP4O75379 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
VAMP4O75379 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VAMP4O75379 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.7 ms