Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC22O60826 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC22O60826 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC22O60826 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms