Protein–RNA interactions for Protein: O60732

MAGEC1, Melanoma-associated antigen C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC1O60732 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAGEC1O60732 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAGEC1O60732 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAGEC1O60732 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEC1O60732 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms