Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MARCH6O60337 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MARCH6O60337 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MARCH6O60337 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MARCH6O60337 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms