Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRICKLE3O43900 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRICKLE3O43900 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRICKLE3O43900 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRICKLE3O43900 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms