Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC28A2O43868 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC28A2O43868 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A2O43868 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC28A2O43868 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms