Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD51CO43502 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAD51CO43502 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD51CO43502 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD51CO43502 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms