Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM1O43490 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM1O43490 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROM1O43490 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM1O43490 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM1O43490 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROM1O43490 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PROM1O43490 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PROM1O43490 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PROM1O43490 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PROM1O43490 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PROM1O43490 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PROM1O43490 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PROM1O43490 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PROM1O43490 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROM1O43490 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROM1O43490 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROM1O43490 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROM1O43490 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PROM1O43490 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PROM1O43490 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROM1O43490 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PROM1O43490 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PROM1O43490 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PROM1O43490 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROM1O43490 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROM1O43490 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROM1O43490 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROM1O43490 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PROM1O43490 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PROM1O43490 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PROM1O43490 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PROM1O43490 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PROM1O43490 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PROM1O43490 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PROM1O43490 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PROM1O43490 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PROM1O43490 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PROM1O43490 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROM1O43490 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROM1O43490 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROM1O43490 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROM1O43490 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PROM1O43490 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROM1O43490 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROM1O43490 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PROM1O43490 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PROM1O43490 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PROM1O43490 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROM1O43490 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROM1O43490 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROM1O43490 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROM1O43490 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROM1O43490 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROM1O43490 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROM1O43490 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROM1O43490 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROM1O43490 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PROM1O43490 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PROM1O43490 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PROM1O43490 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PROM1O43490 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PROM1O43490 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PROM1O43490 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PROM1O43490 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PROM1O43490 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PROM1O43490 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PROM1O43490 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PROM1O43490 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PROM1O43490 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROM1O43490 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROM1O43490 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROM1O43490 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROM1O43490 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROM1O43490 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROM1O43490 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PROM1O43490 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PROM1O43490 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PROM1O43490 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PROM1O43490 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PROM1O43490 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PROM1O43490 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PROM1O43490 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PROM1O43490 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PROM1O43490 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROM1O43490 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROM1O43490 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROM1O43490 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROM1O43490 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROM1O43490 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PROM1O43490 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PROM1O43490 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PROM1O43490 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PROM1O43490 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM1O43490 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM1O43490 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM1O43490 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM1O43490 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM1O43490 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM1O43490 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms