Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HTRA2O43464 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTRA2O43464 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HTRA2O43464 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA2O43464 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTRA2O43464 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms