Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF1O43189 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF1O43189 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF1O43189 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF1O43189 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF1O43189 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF1O43189 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF1O43189 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF1O43189 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF1O43189 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF1O43189 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF1O43189 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF1O43189 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF1O43189 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF1O43189 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF1O43189 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF1O43189 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF1O43189 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF1O43189 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF1O43189 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF1O43189 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF1O43189 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF1O43189 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF1O43189 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF1O43189 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF1O43189 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF1O43189 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF1O43189 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF1O43189 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF1O43189 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF1O43189 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF1O43189 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF1O43189 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF1O43189 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF1O43189 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF1O43189 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF1O43189 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF1O43189 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF1O43189 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF1O43189 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF1O43189 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF1O43189 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF1O43189 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF1O43189 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF1O43189 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF1O43189 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF1O43189 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF1O43189 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF1O43189 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF1O43189 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF1O43189 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF1O43189 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF1O43189 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF1O43189 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF1O43189 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF1O43189 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF1O43189 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF1O43189 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF1O43189 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF1O43189 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF1O43189 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF1O43189 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF1O43189 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF1O43189 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF1O43189 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF1O43189 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF1O43189 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF1O43189 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF1O43189 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF1O43189 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF1O43189 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF1O43189 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF1O43189 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF1O43189 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF1O43189 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF1O43189 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF1O43189 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF1O43189 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF1O43189 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF1O43189 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF1O43189 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF1O43189 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF1O43189 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF1O43189 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF1O43189 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF1O43189 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF1O43189 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF1O43189 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF1O43189 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF1O43189 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF1O43189 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF1O43189 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF1O43189 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF1O43189 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF1O43189 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF1O43189 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF1O43189 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF1O43189 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF1O43189 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF1O43189 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms