Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARPC5O15511 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC5O15511 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARPC5O15511 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms