Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD51BO15315 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD51BO15315 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD51BO15315 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms