Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBDO15205 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBDO15205 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBDO15205 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBDO15205 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBDO15205 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBDO15205 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBDO15205 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBDO15205 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBDO15205 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBDO15205 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBDO15205 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBDO15205 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBDO15205 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBDO15205 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBDO15205 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBDO15205 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBDO15205 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBDO15205 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBDO15205 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBDO15205 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBDO15205 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBDO15205 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBDO15205 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBDO15205 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBDO15205 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBDO15205 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBDO15205 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBDO15205 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBDO15205 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBDO15205 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBDO15205 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBDO15205 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBDO15205 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBDO15205 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBDO15205 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBDO15205 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBDO15205 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBDO15205 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBDO15205 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBDO15205 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBDO15205 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBDO15205 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBDO15205 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBDO15205 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBDO15205 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBDO15205 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBDO15205 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBDO15205 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBDO15205 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBDO15205 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBDO15205 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBDO15205 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBDO15205 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBDO15205 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBDO15205 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBDO15205 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBDO15205 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBDO15205 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBDO15205 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBDO15205 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBDO15205 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBDO15205 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBDO15205 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBDO15205 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBDO15205 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBDO15205 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBDO15205 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBDO15205 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBDO15205 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBDO15205 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBDO15205 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBDO15205 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBDO15205 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBDO15205 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBDO15205 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBDO15205 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBDO15205 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBDO15205 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBDO15205 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBDO15205 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBDO15205 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBDO15205 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBDO15205 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBDO15205 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBDO15205 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBDO15205 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBDO15205 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBDO15205 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBDO15205 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBDO15205 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBDO15205 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBDO15205 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBDO15205 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBDO15205 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBDO15205 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBDO15205 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBDO15205 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBDO15205 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBDO15205 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms