Protein–RNA interactions for Protein: O14939

PLD2, Phospholipase D2, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD2O14939 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLD2O14939 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLD2O14939 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLD2O14939 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLD2O14939 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLD2O14939 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLD2O14939 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLD2O14939 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLD2O14939 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLD2O14939 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLD2O14939 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLD2O14939 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLD2O14939 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLD2O14939 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLD2O14939 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLD2O14939 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLD2O14939 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLD2O14939 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLD2O14939 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLD2O14939 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLD2O14939 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLD2O14939 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLD2O14939 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLD2O14939 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLD2O14939 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLD2O14939 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLD2O14939 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLD2O14939 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLD2O14939 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLD2O14939 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLD2O14939 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLD2O14939 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLD2O14939 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLD2O14939 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLD2O14939 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLD2O14939 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLD2O14939 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLD2O14939 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLD2O14939 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLD2O14939 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLD2O14939 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PLD2O14939 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLD2O14939 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLD2O14939 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PLD2O14939 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLD2O14939 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLD2O14939 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLD2O14939 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD2O14939 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD2O14939 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD2O14939 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLD2O14939 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PLD2O14939 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PLD2O14939 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLD2O14939 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD2O14939 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD2O14939 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD2O14939 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD2O14939 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD2O14939 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD2O14939 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD2O14939 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD2O14939 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD2O14939 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD2O14939 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLD2O14939 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLD2O14939 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PLD2O14939 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PLD2O14939 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLD2O14939 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLD2O14939 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLD2O14939 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLD2O14939 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLD2O14939 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PLD2O14939 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLD2O14939 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLD2O14939 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD2O14939 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD2O14939 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD2O14939 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD2O14939 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD2O14939 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD2O14939 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD2O14939 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD2O14939 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD2O14939 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD2O14939 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD2O14939 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD2O14939 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD2O14939 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD2O14939 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD2O14939 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD2O14939 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLD2O14939 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLD2O14939 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLD2O14939 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD2O14939 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD2O14939 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD2O14939 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD2O14939 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms