Protein–RNA interactions for Protein: O14788

TNFSF11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF11O14788 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF11O14788 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF11O14788 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF11O14788 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF11O14788 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF11O14788 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF11O14788 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF11O14788 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF11O14788 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF11O14788 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFSF11O14788 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF11O14788 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF11O14788 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF11O14788 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF11O14788 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF11O14788 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms