Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE40O14503 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE40O14503 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms