Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A7O00341 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A7O00341 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A7O00341 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms