Protein–RNA interactions for Protein: O00231

PSMD11, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD11O00231 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD11O00231 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD11O00231 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD11O00231 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD11O00231 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD11O00231 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD11O00231 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD11O00231 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD11O00231 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms