Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3KT08 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3KT08 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3KT08 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3KT08 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3KT08 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3KT08 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3KT08 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3KT08 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3KT08 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3KT08 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3KT08 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3KT08 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
J3KT08 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3KT08 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3KT08 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3KT08 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3KT08 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3KT08 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3KT08 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3KT08 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3KT08 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3KT08 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3KT08 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3KT08 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3KT08 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3KT08 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3KT08 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KT08 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KT08 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KT08 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KT08 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KT08 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KT08 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KT08 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KT08 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KT08 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KT08 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KT08 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KT08 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KT08 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KT08 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KT08 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KT08 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KT08 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KT08 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KT08 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KT08 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KT08 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KT08 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KT08 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KT08 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KT08 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KT08 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KT08 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3KT08 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3KT08 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3KT08 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
J3KT08 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KT08 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KT08 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KT08 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KT08 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KT08 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KT08 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KT08 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KT08 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KT08 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KT08 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KT08 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KT08 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KT08 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KT08 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KT08 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KT08 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KT08 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KT08 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KT08 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KT08 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KT08 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KT08 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KT08 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KT08 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KT08 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KT08 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KT08 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KT08 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KT08 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KT08 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KT08 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KT08 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KT08 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KT08 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KT08 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KT08 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KT08 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KT08 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KT08 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KT08 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KT08 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms