Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms