Protein–RNA interactions for Protein: C9JG80

NPIPB4, Nuclear pore complex-interacting protein family member B4, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB4C9JG80 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB4C9JG80 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB4C9JG80 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB4C9JG80 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB4C9JG80 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms